礼部尚书温体仁揣摩皇帝意思，说道：
“李善长之罪，在于知逆谋不发举，狐疑观望怀两端，实属大逆不道。”
“故而太祖诛之，让功臣引以为戒。”
朱由检微微点头，对太祖定下的罪名当然是认可的，又向群臣追问：
“李善长时年七十七，已是风烛残年，太祖为何认为他是大逆不道呢？”
“众卿可曾想过吗？”
群臣想说太祖就是想杀功臣，但是在皇帝面前显然不能这么说。
纷纷表示不知，对这个问题没有回答。
朱由检叹息一声，说道：
“尔等想不明白也不为异，毕竟你们都是忠臣，从未想过谋逆。”
“太祖之所以杀李善长，是因为司马懿留下的教训太深刻，不得不杀之耳。”
“李善长狐疑观望，知胡惟庸逆谋而不检举，太祖一旦生病，对他自然担心。”
“为了不给后人遗祸，只能在群臣请求下将其除去。”
“否则李善长再活二十年，焉知天下姓谁？”
群臣听到这番话，内心悚然一惊，知道是皇帝的发自肺腑之语。
这个理由其实也有人猜测过，但是从皇帝口中说出来，仍旧是让人感到深深的寒意。
谁能想到，司马懿千年前所做的事情，千年后落在了李善长身上，让他落得个被杀结局——
如果没有司马懿老年篡夺权位这件事，李善长多半不会被杀。他所犯的罪过，不一定以谋逆论罪。
但是有司马懿的前例在前，太祖不敢赌这个可能。只要太祖生病身体虚弱，就会怀疑李善长的用心。
在不确定是否能熬死李善长的情况下，太祖最好的选择，就是杀掉李善长。不让这个权位很大的功臣，影响到后续皇帝。
可以说，李善长是因司马懿而死。司马懿千年前射出的一支箭，千年后射中了这个人。
想明白这件事的群臣，兔死狐悲地同时，忍不住埋怨起千年前的司马懿——
如果不是这个人谋朝篡位，皇帝何至于要杀已经致仕的老臣。
司马懿当真是遗祸千年，到现在还在贻害世人。
——
看着群臣的脸色，朱由检知道他们有些被吓到了。所以他把自己之前设立资政院的想法，向群臣道了出来：
“朕之所以设立资政院，定下致仕年龄限制。”
“就是为了使君臣相得，避免胡乱猜忌。”
“大臣年老致仕之后，只要不胡乱插手朝政，把一些人阴谋乱政的事情检举给皇帝。”
“皇帝又怎会怀疑大臣，是否有了逆心呢？”