拔都大军压境，拖雷系重兵环伺，天下诸王尽数臣服，再无反对之声。蒙哥身着大汗冠服，缓步登上祭坛，祭拜长生天，祭拜太祖成吉思汗等列祖列宗，正式加冕登基，成为大蒙古国第四任大汗。
自此，蒙古帝国汗位，彻底从窝阔台一脉，转入拖雷一脉，此后元朝历代帝王，皆为拖雷后裔，黄金家族百年传承格局，彻底改写。
大典礼乐刚歇，祸乱陡生。
窝阔台系宗王失烈门、脑忽、忽察三人，不甘汗位旁落，暗中集结七千旧部，暗藏兵器甲仗，假借入朝恭贺新君之名，奔赴和林，密谋趁蒙哥根基未稳，发动兵变，刺杀蒙哥，复辟窝阔台一脉汗统。
拖雷系细作探知此事，火速密报蒙哥汗。蒙哥生性刚毅果决，杀伐凌厉，得知谋逆之事，当即震怒，决意彻底清算窝阔台系反对势力，永绝后患。
他连夜调兵遣将，命忽必烈率精兵突袭叛军营地，一举将失烈门、脑忽、忽察三人及所有叛党尽数生擒，无一漏网。
随后，蒙哥汗以谋逆大罪，下诏对窝阔台系展开铁血清洗：
摄政皇后海迷失，被剥去服饰，当庭受审，斥责其乱政乱国、庇护叛党，依蒙古宗亲礼法，裹入毡毯，沉于怯绿连河溺死；
贵由汗诸子忽察、脑忽，及宗王失烈门等窝阔台嫡系子孙，尽数赐死，以绝复辟之望；
窝阔台系七十七名参与谋逆的男性宗亲，悉数斩首，鲜血染红怯绿连河畔；
窝阔台系女眷，或赐自尽，或流放偏远草原，贬为奴籍；
前朝依附窝阔台系的镇海等旧臣，尽数清算诛杀，朝堂官员彻底换血，拖雷系心腹重臣悉数上位。
这场血腥清算，持续三日三夜，漠北草原血流成河，曾经煊赫百年的窝阔台一脉，经此浩劫，元气大伤，彻底沦为草原旁支，再无争夺汗位之力。
唯有阔端亲王一脉，因始终恪守臣节，不参与谋逆，远离纷争，安分守己，蒙哥汗感念其忠义，特旨保全其宗族封地，使其得以安稳存续。
拔都见蒙哥汗顺利登基，漠北内乱平定，术赤、拖雷两系盟约稳固，当即率钦察大军西归，建立金帐汗国，割据西域，自此不再干预漠北汗廷政务。
蒙哥汗正式亲政，大刀阔斧革除乃马真后、贵由汗时期弊政，收拢天下兵权，整顿朝纲法度，轻徭薄赋，安抚百姓，恢复民生。他命忽必烈总领漠南汉地军国庶务，旭烈兀统兵西征波斯，阿里不哥镇守漠北祖地，拖雷四兄弟分权共治，蒙古帝国短暂重回一统强盛之局。
而三朝老臣耶律楚材，眼见宗亲屠戮，朝局剧变，一生理想半成空，心中忧愤难平，自此闭门谢客，不问政事，在和林府邸中郁郁寡欢，静待天命。
漠北风雪依旧，起辇谷旧汗长眠，怯绿连河新君登基，黄金家族百年恩怨暂歇，窝阔台时代彻底落幕，拖雷王朝的霸业征程，正式开启。
蒙哥汗登基即位，以铁血手段清算窝阔台系叛党，漠北宗亲势力彻底洗牌，拖雷一脉执掌蒙古帝国权柄，天下初定。可蒙哥身居汗位，却始终未曾松懈，他深知，黄金家族内斗已久，朝野反对势力并未彻底根除，拖雷系的统治根基，仍需以铁腕牢牢稳固。
这一日，和林汗廷大殿之上，文武百官分列两侧，蒙哥汗身着九龙大汗衮服，端坐龙椅之上，面色冷峻，目光扫过阶下众臣，沉声开口：“朕登基以来，窝阔台系叛党虽已伏诛，但其残余势力仍潜藏四方，宗族部众未被彻底拆分，日后必成隐患。再者，太祖、太宗以来，朝纲法度废弛，诸侯兵权分散，若非集权整肃，难安天下！”
太傅唆鲁禾帖尼太后端坐殿侧帘幔之后，神色端庄，缓缓开口：“大汗所言极是，拖雷一脉承继大统，当以安定天下为己任，收拢兵权，整顿法度，拆分强藩，消除宗亲割据之患，方能让蒙古帝国长治久安，不再重蹈宗亲内战之覆辙。”
忽必烈位列群臣之首，上前一步，躬身行礼，进言道：“大汗英明，臣弟有二策，可固汗廷根基。其一，拆分窝阔台、察合台两系封地部族，将其部众分散迁徙至漠北各地，使其无法聚集作乱；其二，设立尚书省，统管天下民政赋税，收回诸侯征税之权，重用汉臣，推行汉法，安定中原汉地，充盈国库，供养三军。”
蒙哥汗微微颔首，随即又沉声道：“二弟所言，正中要害。拆分藩部之事，交由阿里不哥全权处置；中原汉地事务，交由忽必烈总领，旭烈兀整肃兵马，筹备西征，平定西域诸国。至于朝中旧臣，凡不遵汗令、心怀异志者，一律罢黜，绝不姑息！”
“臣等遵旨！”
忽必烈、旭烈兀、阿里不哥三兄弟，及满朝文武纷纷躬身领命，大殿之上，尽是新君铁腕治国的威严之气。
诏令既出，漠北各地迅速推行。阿里不哥亲率大军，奔赴窝阔台、察合台系残余封地，将其宗族部众逐一拆分，迁往不同牧场，收缴其兵权、牧地，彻底瓦解两系宗族势力，但凡有敢违抗者，当即以叛党论处，杀伐果断，漠北诸王无不震慑，再不敢有半分异心。
与此同时，阔端亲王在叶密立封地，听闻蒙哥汗拆分藩部的诏令，当即召集麾下众将，当众宣告：“蒙哥大汗顺应天命，安定天下，我窝阔台一脉，早已无争霸之力，今日唯有谨遵汗令，拆分部众，安分守己，方能保全宗族，诸位切勿生出异心，引火烧身！”