原本他下潜到如此深度的水下，受到水压的影响会感到相当的痛苦，毕竟他是和初号机感官共享的。
就算出号机的体积巨大，给他带来的压力也几乎相当于普通人没有任何装备的情况下，潜水到接近一百二十米的深度。阑
这种巨大的水压，虽然不至于致命，但也会让人痛苦万分，难以集中精神。
但现在，他却完全没有这种痛苦的表现，并不是因为他现在已经适应了这种感觉，而是因为他已经可以精确的控制at力场，覆盖在机体表面，抵消掉水下巨大的压力，逐渐熟悉了这种力量的使用后，他不止可以降低自己受到的水压，还可以降低自己在水下活动时受到的阻力，灵活程度得到了大幅度提升。
在地图的指引下，十分钟不到的时间就已经找到了第一处残骸。这也是最重要的一处残骸，二号机的头颅，这个位置不只是头部，还是插入栓进入的位置，也就是二号机驾驶舱所在的位置。
碇真嗣将残骸固定在钢缆之上，与地面联系之后，湖边的绞盘就开始转动，将残骸运送到湖边，在那里已经有人开着工程机械，将残骸运输出来。
在海边的位置，工程队挖出了一个大坑，大坑大致成人形，是一个平躺在地面的姿态，大概足以一个身高五十米的巨人躺进去。
二号机头部的残骸，就被运送到这里，然后通过一系列的支架，固定在大坑之中头部的位置。
初号机又陆续从水下将更多的残骸运送出来，那都是二号机身体的一部分，在和量产机战斗的最后阶段，二号机没电后无法继续行动，最终惨遭分尸，在战斗结束的时候，已经变成了一块块碎片散落在地下基地的各处。阑
初号机是根据战斗过程中，基地各地的监控摄像头所记录下来的图像，对那些散落在各地的碎片进行搜索的。
值得庆幸的是，二号机的骨架基本保留完整，量产机真的像是一群秃鹫一般，对二号机进行蚕食，但他们也像是秃鹫一般将骨架留了下来。
明日香在看到如此凄惨的二号机的时候，忍不住捂住了自己的眼睛，那天经历的一切，对于她来说已经留下了心理阴影，不过她从那种状态中能够挺过来，也证明在那过程中，她的心智经过锻炼也已经强大到了远超常人的程度。
最终被放置在大坑中的，是一具几乎完整的骨架，骨架之上还有少量的血肉，以及一部分经络和机械，也被拼装在相应的位置。
支撑着这些骨架的，是大量木质的脚手架，木头在这个时代，反而成了比金属更加珍贵的材料，森林已经融化消失掉了，木材这种东西也是越用越少，但幸存者们还是把这些宝贵的木料用在了大坑里。
因为根据幸存者中EVA工程师的推断，二号机在重新恢复了血肉之后，这些原本作为支撑结构的脚手架，会直接插入到二号机的内部，如果是金属结构的话，很可能对机体造成相当严重的破坏。
相比之下，如果是有机物的话，则有可能在这个过程中直接被二号机的机体吸收转化为身体的一部分，也就不需要在修复完成之后将里面的钢筋一点点清理出来，造成二次伤害了。阑
残骸的搜集过程足足持续了两周时间，碇真嗣基本上将二号机的外部装甲和骨架全都搜集了上来，量产机吃掉的只是血肉，这些结构基本都保持完整，重新套上了一层外装甲的二号机，从高空中俯视有那么点儿亡灵骑士的感觉。从铠甲的缝隙之中能够看到里面巨大的骨骼。
而随着准备工作完成，大坑与海水相互联通，红色的海水涌入了大坑之中，将二号机的残骸淹没。
明日香看着残骸上的插入栓，脸上露出不信任的表情：“我真的要进去吗？现在这种状态的机体，就算是我进去了，也根本没有任何意义吧！这上面好多骨头都没连在一起，我怎么操控他们，你是在侮辱我的智商吗？”