这时有王府护卫来报：「殿下，城北来了一队石柱土司兵，约有两三千人，领头的姓秦，说是受张部堂调令，协防桂林，抚台请示殿下是否放人入城？」
朱履祜眉头皱起：「石柱？什么穷地方的土司，也来桂林打秋风？你回军政要务，本王不宜谋划，让抚台看著办就是。」
护卫退下。
靖江王又与管家商议起漓江下游的土地来，这些地方目前为南澳军所占，等叛军退去，就能趁机占下，毕竟有战乱就有死伤，多些无主之地，再正常不过了。
过了不久，护卫又急忙返回。
「殿下，城外土司兵说不进城也行，只是恳请府衙发放粮草，还要与参将见面，督建城防。」「放肆！」朱履祜怒道，「要饭要到本王头上了？滚！」
之后数日，白杆兵就驻扎城外，粒米未从府衙中求来。
秦良玉每日忙于与知府、巡抚扯皮，眼睁睁看著桂林周边州县被一个个攻破，却无可奈何。四月初十。
南澳西路军攻破永福县，北路军攻破阳朔，桂林正面已无任何屏障，完全暴露在南澳兵锋之下。靖江王此刻才如梦初醒，连忙请秦良玉入城，并召四周军队来援。
然而已来不及了。
入桂林的两条水道已被南澳军完全封死，四周卫所、营垒，也已被逐个击破。
桂林已成瓮中之鳖。
四月十二，白浪仔率西路军从运河入漓江与北路军会师。
两军兵员合计一万五千余，有海狼舰三十余艘，其余运兵、运粮的大小舟楫合计千余艘。
在漓江江面绵延二十余里，连樯接舵，舶舶蔽江。
桂林外围的几个小营垒见此情景，也纷纷投降，桂林彻底成孤城一座。
四月十三，南澳军两路齐出，从漓江、桃花江两面将桂林团团包围。
桂林城呈南北狭长之状，漓江、桃花江本是天然的护城河，可因没有水师，反倒被南澳军借水道困在城中。
雷三响选择将南澳军大营建在桂林以东，与桂林一江之隔。
桂林城东葵水门。
桂林城中要员均至，手搭凉棚朝南澳军营眺望。
只见一座高台从其营中拔地而起，台高三丈，顶端与桂林城墙几乎平行，而且还在不断加高。广西都指挥使见状松了口气：「抚台放心，叛军既建望楼，说明没有速攻打算，我们固守待援即可。」见巡抚又不放心的看向河道，都指挥使又道：「漓江水道狭小，南澳军的福船炮舰也进不来，那些海沧船虽也装了火炮，却没有攻城能力。」
巡抚沉思片刻：「不知秦总镇有何见解？」
马祥麟闻言冷哼一声，白杆兵半个月前到桂林城外，巡抚、巡按、知府、都指挥使一个个鼻孔朝天，当他们是叫花子，一粒米都不愿给。
现在敌军围城，终于想起问秦总镇见解了。
前倨后恭、短视至此，令马祥麟极为不齿。
秦良玉不以为意，冷静说道：「观诸广西塘报，林逆长于火炮、招降之术，短于云梯攻城之法。因此，要备好足量的砖石、沙土，随时填补城墙缺口，另备大木撑住城垛、城墙，防止塌陷。同时，可以减少城头驻军，兵丁也要在城头分散开，以免被炮击死伤过重。
遇敌炮击时，除哨兵外，其余士兵下城躲避，待停炮再上城头。