山后的迁回部队也与倭兵的后卫部队遭遇，明军士兵凭借火统的优势，先一轮射击便放倒数十名倭兵，随后发起冲锋，很快便击溃了后卫部队，彻底切断了倭兵的退路。
激战持续了三个时辰，山城中的倭兵渐渐抵挡不住明军的猛攻。
他们的伤亡越来越大，弹药也消耗殆尽，不少士兵开始丢弃武器，跪地投降。
但仍有数百名顽固的武士与足轻退守到山城深处的本丸（主城堡），负隅顽抗。
「放火烧城！」
毛文龙见倭兵退守本丸，当即下令。
明军士兵将火把投向本丸的木质建筑，火势迅速蔓延，浓烟滚滚，呛得里面的倭兵难以呼吸。
本丸的大门被火炮轰开，明军士兵一拥而入，与顽抗的倭兵展开最后的厮杀。
倭兵统领手持武士刀，疯狂地砍杀著明军士兵，身上早已被鲜血浸透。
一名明军百户见状，手持长刀上前迎战，两人刀光剑影，激战数十回合。
最终，明军百户找准破绽，一刀劈中倭兵统领的腰腹，将其斩杀于地。
随著统领战死，最后的顽抗也宣告终结。
山城中的倭兵要么被斩杀，要么跪地投降。
明军士兵清理战场时发现，此次攻城战，共歼灭倭兵六百余人，俘虏五百余人，其中包括多名萨摩藩的下级武士与奉行随从。
而明军也付出了伤亡两百余人的代价，琉球青壮伤亡百余人。
毛文龙踏入残破的本丸，望著满地的尸体与废墟，脸上露出一丝凝重。
他转身下令：「将俘虏全部戴上镣铐，与此前的倭俘汇合，一同送往台湾挖矿、种番薯！
安抚岛上的琉球百姓，清查琉奸余孽，彻底肃清萨摩藩在琉球的残余势力！」
「遵命！」将士们齐声领命。
此时，琉球国王尚丰也率领群臣赶到山城，看到明军攻克最后一座倭人据点，尚丰激动得热泪盈眶，对著毛文龙深深一揖。
「毛将军神威，彻底驱逐倭贼，还我琉球完整河山！
我琉球上下，永世感念天朝上国的庇护之恩！」
毛文龙扶起尚丰，自光望向辽阔的大海，心中豪情万丈。
琉球只是一个开始罢了。
大明的下一阶段的目标，是日本本岛！