通事（翻译）科：设置专门科目，培养精通番语（马来语、波斯语、日语、朝鲜语、
乃至简单的葡萄牙语）的翻译官，在口岸与外夷交涉，待遇从优。
第二条：选与调回避法：严禁现任官长的直系亲属、同族在其管辖范围内担任海衙要职（如度支、监察、洋税、船政等关键司职）。
轮调法：各司郎中、分署同知及大使，任期三年，期满考核，优者升调、平者调任、
劣者罢黜。防止官员在某地、某部深耕太久形成利益集团。
乡贤、商董荐举制：允许沿海州县有德望的士绅、资本雄厚的商帮会首，联名保举通晓海事、品行端正的海商子弟入海衙实习，经考核通过后破格录用。
卷四：财政与赋税制度财政是开海之命脉。本章重点在于宽税基、简税则、强审计、严处罚。
第一条：税种船税（丈抽法）：
由船政司依《大燕商船建造标准》登记注册的船只，按吨位征收。
200石以下渔船：免船税，但纳入船籍管理。
200—500石商船：每百吨/每季（约3个月）征收白银十五两。
500—1000石商船：每百吨/每季征收白银二十两。
1000石以上远洋福船：每百吨/每季征收白银二十五两。
货税（常关制改良）：
货物分上、中、下三等，税率为：上等货值百抽十一（11%）；中等货值百抽五点五（5.5%）；下等货值百抽三点三（3.3%）。
分级依据：绸缎、瓷、锦、香料、珠宝等为上等；棉布、铁锅、漆器等为中等：粮食、竹木、陶器等为下等。
货物清单由筹策司每年修订，报内阁备案后公示。
引费（船引许可费）：
船引为每年发放一次的远洋航行许可证，每张定价白银一百两整。中签者凭令可出海。
每年总额根据海贸量调整（如第一年一百张，视情况逐年递增或递减）。
通商码头费（泊位税）：
由海衙划设码头泊位，按天计费，由仓储货榷司收取，用于码头维护与扩建。
第二条：征收方式三单合一：商船出港前，需持《船引》《货物清单》《纳税凭证》三单，由港口洋税司核对无误后方可放行。缺一不可，伪造或涂改视为走私，货物没收。
统一银庄缴费：商贾缴税统一至海衙指定的「海运银庄」窗口办理。银庄开具的凭证需加盖银庄主印和海衙洋税司副印方为有效。
设港关与陆关：在通商口岸设立海关卡口，在通往内地的要道（如进出广州的大庾岭、梅关，松江的运河卡口）设立陆上税关，对进口内销的番货征税，避免走私免税。
第三条：审计与处罚双审制：海衙度支司每年独立审计；都察院每三年委派巡海御史进行一次全面审计，结果直接上达天子。