将袁崇焕打入监狱，是出于两个原因。
一是给建奴“可趁之机”，毕竟建奴最头疼的就是宁远的袁崇焕的。
如今袁崇焕下狱了，他所担心的绕道攻击会被袁崇焕发现，就会大大降低。
传出去，都说是袁崇焕五年平辽惹怒了皇帝，因此获罪，这个理由很正。
第二个原因是在保护袁崇焕，如果建奴入关，他是真怕袁崇焕会重走历史上的老路。
历史上己巳之变发生后，袁崇焕得知消息之后，从宁远带兵勤王，可行动却是极其诡异。
皇太极走，他就追，皇太极停，他也停，总在皇太极屁股后面转悠。
好不容易抢在在遵化、蓟州、通州三处设卡堵截皇太极，但均没有成功。
皇太极直接从通州绕道顺义再绕道三河，从东面攻入北京。
而后，一而再、再而三的要求崇祯允许他带领军队进城，外地兵入京城，这是大忌，袁崇焕不会不知道，可依旧如此的要求。
关键问题是，建奴撤军后，袁崇焕不去追击建奴，还坚持要求带兵入城，简直是不能理解。
因此他获得的九罪中的纵敌长驱，顿兵不战，援兵四集、尽行遣散、兵薄城下，潜携喇嘛、坚请入城。
这五项罪名都是跟己巳之变有关系，万一袁崇焕再走这个老路子，那杀还是不杀？
杀，但袁崇焕在辽东是有功的，特别是宁远大捷等，等于给大明机会。
可不杀，这种纵敌长驱，顿兵不战的罪名，却是实实在在的。
既然确定不了，那干脆给他关起来，等将建奴入关的兵力围杀了再说！
可外人不知道皇帝的打算，只知道蓟辽督师被皇帝关起来了，虽然不敢明面上谈，但私下猜测满天飞。