V99档案的真相，终于在所有人面前，被掀开了一角。
苍边惠美从其父亲好友西崎先生那里，了解到了部份三年前的真相。
西崎先生不仅是苍边惠美父亲的同学兼好友，还是三年前，一起在66号研究所中工作的同事。
不同的是，苍边惠美的父亲没能逃脱，西崎先生却侥幸逃得一命。
只是幸存下来的西崎先生，如今很少与外人沟通，显得格外孤僻，好似是受到了那场事故的影响，留下了永久性的创伤。
西崎先生最终还是选择，将三年前的真相，告知苍边惠美。
或者说，这是迟来了三年的见面。
三年前，各个领域的科学家们，被召集到岐阜山里的一座研究所里，也就是宇宙装备研究所，第66号实验设施。
目的是修复从美国运来的巨大装置的残骸。
根据研究，那是一个可以生成虫洞的系统，能够连接地球与银河的尽头。
在科学家们的努力下，修复工作顺利完成，并且启动了装置。却没想到在装置启动不久后，虫洞失去了控制，开始吞噬周围的科学家们。
身为计划的负责人，苍边惠美的父亲，苍边树，就在虫洞的中心位置，当场被虫洞吞没。
西崎先生能够幸免于难，是因为他负责在外围监控室里观测实验，才侥幸逃得一命。
之所以说西崎先生与苍边惠美的见面，是迟到了三年的会面，是因为早在实验的前一天，苍边树就为了以防万一，将一样遗物交给了西崎先生，如果他出了什么事的话，就将遗物转交给苍边惠美。
然而，在实验之后，察觉到防卫队的态度后。
西崎先生意识到，这次的实验很不简单，如果他将苍边树的遗物交给苍边惠美，很有可能会引起防卫队的相关人员的注意，将苍边惠美卷入到危险之中。
因此，西崎先生决定独自保守秘密，逐渐远离人群，变得沉默寡言。
直到苍边惠美找上门，一开始西崎先生是不愿意将苍边惠美卷入其中的，但最后，西崎先生还是想明白了。
既然苍边惠美能找到他，就代表苍边惠美已经在调查那件事了，纵使他什么都不说，苍边惠美也会遭遇危险。
还不如他将自己所知道的一切，告知苍边惠美，希望能助苍边惠美一臂之力，纵使真的遭遇危险，也能有机会抓住一线生机。
顺便将其父亲的遗物归还给苍边惠美。
看起来作为间谍，见识过最多黑暗的苍边惠美，实际上才是那个，被保护的最好的人。