百官知道皇帝还要接下来处理李承乾作乱的案子，当下都留在皇宫用膳了。
吃完饭之后，百官再次来到太极殿，见太子府中的侯君集等人，全部被抓捕来了。
李世民看见他们，心中大怒，指着骂：“朕何曾亏待你们？赵节，你是刺史，还嫌官职不够大吗？杜荷，你是驸马，朕还对你不好吗？公主几次三番诉说你的不好，朕都多加包容！哪里知道你们这样狼子野心！”说着，又看着侯君集，说：“朕本想令人直接杀了你，但是，想到你的功劳，朕不忍心让你面对刀笔之吏，所以让你亲自面圣，你还有什么话好说的？”
侯君集此时才后悔不已，跪下去，哭着说：“皇上，罪臣该死，罪臣该死！罪臣就是想着，跟随您发动玄武门之变，之后又灭吐谷浑、高昌国，以为功高而得不到应有之爵位，因此贪心不足，才会跟太子作乱······”
“你已经身为将军了，还有什么不满足？难道你还要封侯拜王？”
李世民大声训斥。
侯君集无话可说。
李世民念在他有功劳的份上，对众臣说：“朕想饶他一命，可不可以？”
大臣们都跪下去，说：“谋逆大罪，不处死，无以警示后来者！”
李世民听了这话，只得对侯君集说：“君集，你我只有永别了！”说着，眼泪流了下来。
侯君集也流泪不止，说：“皇上，罪臣别无他求，只愿保全一子，以奉祭祀！”
李世民摆摆手，说：“只杀侯君集一人，他的妻子，流放岭南······”
“谢皇上！”
侯君集说着，站了起来，向外面的监斩台走去了······