杜文焕站在明军大营外，看到西安府城的城墙已经被攻破，乱民们渐渐抵挡不住，便下令道：「全力攻城，拿下西安府城，活捉李老根！」
明军士兵闻言士气大振，纷纷朝著城墙上冲去，越来越多的明军士兵冲上城墙，乱民们节节败退，一个个倒在血泊之中。
李老根见状，知道西安府城已经守不住了，便猛地举起手中的长刀，朝著自己的脖颈砍去，想要以死明志。
就在这时，一名明军士兵猛地冲上前，一把夺下了李老根手中的长刀，将他按倒在地，活捉了起来。
乱民们看到李老根被活捉，心中顿时大乱，再也没有了反抗的斗志，纷纷放下手中的武器，跪地投降。
杜文焕率领大军顺利进入西安府城，接管了西安府。
接管西安府后，杜文焕便下令停止进攻，派人收缴乱民手中的武器，将投降的乱民全部看管起来，同时派人安抚民心，发放粮食给受灾的百姓。
随后杜文焕便下令将李老根斩首示众，以做效尤，同时派人清理西安府城内的残余乱民，整顿西安府的局势。
平定西安府后，杜文焕便率领大军前往陕西其他府县，清剿残余的乱民。
此时的陕西各地大多已经投降，只有凤翔府、汉中府还有少数顽固分子负隅顽抗。
杜文焕率领大军一路势如破竹，先后平定了凤翔府、汉中府，清剿了所有残余的乱民，斩杀了乱民首领。
短短一个多月的时间，杜文焕便率领大军平定了陕西全省的民变，完成了朝廷交给的平叛任务。
平叛结束后，杜文焕便按照朝廷的旨意开始处置那些参与民变的乱民。
将那些顽固抵抗、拒不投降的乱民全部贬为奴隶，押解至朝鲜、辽东、台湾、琉球等地屯田。
将乱民首领的家春及其亲信一律流放至边疆屯田。
对于那些主动投降的乱民，则按照朝廷的旨意赦免他们的罪行，发放粮食和农具，让他们返乡归田，恢复生产。
与此同时，清田司、救灾司的官员也已经抵达陕西，按照朝廷的旨意开展工作。
清田司的官员深入陕西各地，清查豪强劣绅隐瞒的土地，追缴他们贪污的赈灾款，严惩那些与乱民勾结、瞒报灾情的地方官员和御史。
陕西的豪强官员们平日里欺压百姓、贪污受贿，无恶不作，如今面对清田司的清查，一个个惶惶不可终日，纷纷被查出罪行，有的被斩首示众，有的被流放边疆，有的被贬为庶民，家产被全部抄没用于赈灾。
救灾司的官员则全力开展救灾工作，在陕西各地开设粥棚，发放赈灾粮款，安置受灾的百姓，同时推广番薯、玉米等高产作物，疏通水利，指导百姓们开垦荒地，恢复生产。
朝廷下拨的三十万石赈灾粮、五十万两白银以及大批农具和种子也陆续运往陕西，发放到百姓们的手中。
百姓们得知消息后心中大喜，纷纷感激朝廷的救济，主动返乡归田，投入到春耕生产之中。
草原察哈尔部、土默特部的士兵协助平叛结束后，杜文焕便按照朝廷的旨意给予了他们少量的赏赐，随后令他们返回草原。
杜文焕随后便下令加强陕西边境的防务，留半数兵卒驻守延绥镇、甘肃镇、宁夏镇三镇，防备草原部落趁机作乱，同时整顿卫所兵，加强训练，提高军队的战斗力。
杜文焕将陕西的局势稳定下来后，便派人将平定陕西民变的消息快马加鞭禀报给了京城的朱由校，详细禀报了平叛的过程、处置乱民的情况以及陕西后续的治理情况。