随后独自抵抗的多米尼克就被普鲁士人俘虏了。
普鲁士军官想让他指出索瓦尔森林的小路，免得法军反攻，但多米尼克拒绝了。
普鲁士军官本想枪毙他，但经过梅尔利埃大爷的求情，就先将他先囚禁起来。
半夜，他的爱人弗朗索娃丝爬进窗户，将他放走了。
第二天，普鲁士军官发现了多米尼克逃跑时杀死了哨兵，就威胁弗朗索娃丝去森林里寻回多米尼克，否则就杀死她的父亲。
面对死亡，多米尼克毫不畏惧，主动回到村庄，用自己的生命换回了爱人的父亲。
就在多米尼克被执行枪决的时候，法军从森林里冲了出来，发起了反攻，消灭了盘踞在磨坊防守的普鲁士人。
但多米尼克已经死了，磨坊主梅尔利埃大爷中了流弹也死了；磨坊在法军的炮击下成了一堆废墟。
故事说到最后，左拉的声音充满了疲惫：
“上尉第一个冲进院子，这是战争开始以来他打的唯一的胜仗。他情绪昂扬，纵声大笑。
他一眼看见在这磨坊的一片废墟中，一个姑娘像一尊大理石的雕像似的端坐在她丈夫和父亲的尸体之间。
上尉向她举刀致敬，大声叫道：‘胜利了！胜利了！’”
这个充满嘲讽意味的结尾，让现场所有人都陷入了沉思，而左拉则为它添上了更为残酷的尾声：
“多米尼克独自留在大厅内继续向前面射击，士兵们都走了，他却一点不知道。
他只是不停地放枪，一枪消灭一个敌人……”
多米尼克在法军进攻前就死了，胸口十二个枪洞——那正在射击的是谁？是他的灵魂吗？
一个比利时人，为了法国人而战，死在了普鲁士的枪口下，即使化为灵魂都不曾停止射击……
左拉的故事让所有人都安静下来，刚刚情绪激动的莫泊桑也沉默不语。
在他讲完“磨坊之役”前，除了莱昂纳尔，其他五人都低估了这次故事的构建难度。
他们以为赞美一下普通军士的英勇、法国人民的抵抗，或者嘲讽一下上流社会的堕落、无能就能过关。
但“磨坊之役”主题的复杂程度和批判深度，远远超乎他们的想象。