谣言越传越广，不少不明真相的百姓都被煽动了。巫都带着几千名信徒，包围了旧港的明伦堂，喊着“烧死孔新！赶走汉人！”的口号，要烧了学堂。
邓奉听说后，立刻带着军队赶来，准备武力镇压。孔新却拦住了他：“邓将军，不要动手。要是杀了他们，只会让更多的百姓相信谣言。我要和巫都斗法，比谁能求来雨，比谁能让庄稼丰收。谁赢了，谁就说了算。”
邓奉皱着眉：“这太冒险了！要是输了，我们之前的努力就全白费了！”
“我不会输的。”孔新笑着说，“我求的不是雨神，是科学。”
他和巫都约定，各自选一块一百亩的荒地，耕种三个月，三个月后，谁的庄稼产量高，谁就是赢家。要是孔新输了，他自愿离开南洋；要是巫都输了，所有巫师都要解散，再也不准散布谣言，不准干涉部落的事务。
巫都满口答应。他觉得，自己当了几十年的巫师，求雨祈福是家常便饭，怎么可能输给一个只会教书的儒生？
斗法开始后，巫都每天带着巫师们，在地里跳大神，杀牛祭祀，祈求雨神保佑。而孔新则带着学生和弟子们，修水渠，打水井，把远处的河水引到地里；又用堆肥法，给土地施肥；还教百姓们合理密植，除草防虫。
一个月后，南洋果然下了一场大雨。巫都得意洋洋，到处宣扬是自己求来了雨，孔新输定了。可他不知道，孔新早就根据邓晨给的气象资料，预判到了这场大雨。
三个月后，到了收获的季节。
巫都的地里，因为没有浇水施肥，庄稼长得又矮又瘦，一亩地只收了不到五十斤粮食。而孔新的地里，水稻长得又高又壮，穗子沉甸甸的，一亩地收了整整三百斤，是巫都的六倍！
看着堆成小山的粮食，所有的百姓都惊呆了。巫都脸色惨白，瘫坐在地上，一句话都说不出来。
孔新走到他面前，笑着说：“巫都先生，现在你信了吗？没有什么雨神，也没有什么邪魔。只要我们勤劳肯干，用对方法，就能有好收成。”
巫都沉默了很久，终于站起身，对着孔新深深鞠了一躬：“我输了。我以后再也不做巫师了，我要跟着你学汉字，学种地，教部落里的人，过好日子。”
其他的巫师也纷纷放下了法器，要求跟着孔新学习。那些被煽动的百姓，也都跪在地上，给孔新道歉。
经此一战，再也没有人敢质疑孔新，再也没有人敢反对办学。整个南洋的部落，都纷纷邀请孔新去他们那里建学堂。