正月二十七日，文华殿，朱由检召集阁臣、九卿，以及三法司和太常寺相关官员，处理钱千秋案。
这件案子是温体仁重新提起的，朱由检首先询问他：
“温卿参钱谦益受钱千秋贿赂，以‘一朝平步上青天’为关节，犯下科场舞弊之罪。”
“这件事可有实据吗？”
温体仁毫不犹豫地道：
“臣参钱谦益的罪名，字字都是实的。”
朱由检继续问道：
“钱千秋案刑部已经结案，难道还有疑问吗？”
温体仁反驳结案一说，回道：
“刑部将金保玄、徐时敏问罪，钱千秋却逃了，并不曾到官，此案怎算了结？”
朱由检闻言点头，认可这个说法。涉案的主犯逃了，当然不能说结案。
所以他转向钱谦益，询问道：
“温体仁参卿受钱千秋贿赂，以‘一朝平步上青天’为关节，可是真的么？”
钱谦益当然不承认这件事，急忙辩解道：
“臣于天启元年典试浙中，一时号称得人，初不闻有钱千秋之事。”
“到京复命之后，才知道钱千秋一事，当即上疏参他，现有奏案在刑部。”
朱由检听到回复还没有说什么，温体仁径自插话，语气咄咄逼人，责问钱谦益道：
“钱千秋逃了，徐时敏、金保玄是中间人，在刑部亲口说和钱谦益有关，这件事如何赖得过？”
钱谦益继续辩解，回道：
“臣不敢多辩，现有卷案在刑部。”
“钱千秋试卷原是真定府推官郑履祥取的上卷。臣为总裁，不能遍阅，只看他七篇文字，又看他后场也通，不曾看到结尾七字。一时疏略之罪，臣不能辞。”
只承认失察之罪，想要把这件事糊弄过去。
朱由检对此当然不满意，询问苏茂相道：
“对于钱千秋案，刑部有什么话说？”
刑部尚书苏茂相回道：
“此案是在天启二年审判，臣当时尚未到刑部，不曾见过案卷。”
“如今刑部审判职权移交大理寺，案卷也在移交，一时难以把案卷找出来。”