虽是换届期间，朱由检在理藩院的动作，仍旧引起很多臣子关注。
藩国九服体系、十二藩长设置，都是有可能写入分封礼法的制度。
一些力求限制皇权的臣子，对皇帝和理藩院直接商议定策，心中非常不满。
但是大臣们的态度却很一致，那就是任由皇帝在理藩院下旨，尊重皇帝的权力。
否则皇帝生气了肆意插手换届，对他们来说更麻烦。
理藩院的权力就算要争夺，时间也不是现在。
和皇权争夺几百年的他们，有着足够的经验。
朱由检自然也知道群臣的心思，在朱元璋废除丞相直面群臣后，大明皇帝和臣子权力的争夺，一直是大明政治的主线。
在文官的不断争夺下，他们用廷推会推掌握了用人权，用廷议和阁议、部议掌握了行政权，用廷鞫和三法司会审掌握了司法权，并且通过兵部掌握军事权，通过科道控制监察权……
大明的所有权力，几乎都被文官掌握。
朱由检登极后外人看来很强势，堪称世宗嘉靖皇帝之后权力最大的皇帝。
但是他自己却很明白，自己的强势只是一时的。文官最核心的大臣廷推、大事廷议、大狱廷鞫这三大权力，自己根本无法推翻。
他这个皇帝最大的权力，其实是罢免被弹劾的官员。历史上崇祯皇帝就是利用这个权力不断试错，更换被廷推出来的官员。
但是官员更换太快，会让大臣建不起威望，朝廷的政策到地方也会变成一纸空文。
朱由检汲取历史上的教训，对更换大臣一直很慎重。就算某些大臣不合格，他也捏着鼻子忍下来。
为此，他还制定了任期制，让官员在任期内安安心心工作，不犯大错就不会罢免。
换届的主导权，他也交给了新一届朝堂大臣。让他们按自己的意愿安排属官和地方官员，方便接下来三年施政。
这么多的权力都放出去了，如果群臣还对他的权力不尊重。他会毫不犹豫地使用罢免权和否决权，维护自己的权威——
这两个权力，都是朱由检授与主官否决权时被明确的。皇帝可以否决廷推、廷议的决议，如同对奏疏留中不发一般。
也就是说，他能随时插手换届。
大臣们知道这个后果，只能看着皇帝在换届期间整顿理藩院。
普通官员没有这个认识，他们觉得什么事情都能插嘴，理藩院事务同样包含在内。