理清楚了源头后，朱由检问群臣道：
“祝枝山《野记》不可信，李贤的《天顺日录》可信吗？”
群臣哑口无言，没有人为李贤说话。
尤其是《天顺日录》对景泰皇帝多有诋毁之处，被正直的大臣很看不起。
之前评选紫阁功臣时，李贤就被皇帝和群臣认定道德败坏。如今景泰皇帝都被当今皇帝上庙号了，自然更没有人为他辩解。
朱由检见群臣如此表现，当即就下令道：
“《天顺日录》同样应该禁毁，引用它的图书，也要全部查禁。”
“李贤在永乐六年出生，他对方孝孺的记载，已多有讹传之处。”
“更晚出生的人，又有多少可信呢？”
“刘先生编撰方孝孺传，一定要注明史料来源，不要把以讹传讹的内容加进去。”
这个命令下达后，群臣一时哗然，知道若是按这个命令执行，有关方孝孺的图书，基本要全部覆没。
这让他们觉得难以接受，很多人纷纷进言，认为不应当因为这一点，就查禁所有图书。
朱由检见到这个情况，怒气勃发地道：
“不查禁这些书籍，难道要让诽谤的文字流传天下吗？”
“建文之事，本来早有定论。”
“但是自《天顺日录》流传以来，却出现了异议。”
“尤其是诛十族之事，被祝枝山《野记》编造出来后，竟然堂而皇之地出现在《皇明通纪》等私修史书上，让一些不学无术的文人，对此信以为真。”
“这样的书籍不查禁，难道要让它继续误导世人吗？”
“成祖在世间的形象，就是被这些人败坏！”
忿怒地骂了诋毁成祖的人一通，朱由检又拿着《野记》骂道：
“还有这个编造诛十族的祝枝山，难道就不通礼法吗？”
“他只知道十比九大，却不知道相比诛九族，更严重的是诛三族。”
“刘先生你来说说，九族和三族都有哪些。”
刘宗周一向推崇方孝孺，此时见方孝孺被诛十族、甚至夷族都被皇帝否认，精神也受到了冲击。
不过面对皇帝的问题，他还是收拾心情答道：
“九族者，上至高祖，下及玄孙，皆是同姓之人。《大明会典》有本宗九族五服正服之图。”