平海之屠
平海之屠指的是公元1647年（南明永历元年七月），清军在福建平海卫进行的一次大规模屠城。
根据《明清史料》、《南明史》等记载，1647年南明绍宗皇帝殉国后，遵奉鲁监国的义师在闽浙两地依然相当活跃。是年七月，南明同安伯杨耿领兵一度收复平海卫。满清援军赶到后，杨耿兵被迫撤退，平海卫百姓惨遭屠杀。被屠杀的无辜百姓具体人数不详。史称平海之屠。
邵武之屠
邵武之屠指的是公元1648年（南明永历二年四月），满清“福建左路总兵”王之纲在福建邵武县进行的一次大规模屠城。
根据《郑成功档案史料选集》等记载，1648年江西金声桓、王得仁反正归明后，福建义民举兵响应。义军攻占邵武县城后，复为满清兵所败，城中起而响应的绅民惨遭屠戮。被屠杀的无辜百姓人数不详。史称邵武之屠。
同安之屠
同安之屠指的是公元1648年（南明永历二年八月十六日），满清“靖南将军”陈泰、“浙闽总督”陈锦、“福建提督”赵国祚在福建同安县进行的一次大规模屠城。
根据《郑成功档案史料选集》等记载，1648年李成栋反正后，闽南地区复归明朝旗下，但闽系将领多为排斥。是年七月满清军队进攻同安，郑成功援军因风向不利受阻。同安城破后，守城将士悉数杀身成仁，满清军队屠城，血流沟渠。大约有五万人被屠杀。史称同安之屠。
湘潭大屠杀
1649年正月二十一日清军攻入湘潭，南明督师何腾蛟被俘。清郑亲王济尔哈朗下令屠城，“屠至二十六日封刀，二十九日方止”。湘潭城中百姓几乎全被杀光，城中不满百人。”(康熙三年《湘潭县志》)
南昌大屠杀
1648年，金声桓、王得仁在江西起兵抗清，七月初十清军包围南昌。次年三月间，南昌城陷，清军屠城。
“妇女各旗分取之，同营者迭嬲无昼夜。三伏溽炎，或旬月不得一盥拭。除所杀及道死、水死、自经死，而在营者亦十余万，所食牛豕皆沸汤微?集而已。饱食湿卧，自愿在营而死者，亦十七八。而先至之兵已各私载卤获连轲而下，所掠男女一并斤卖。其初有不愿死者，望城破或胜，庶几生还;至是知见掠转卖，长与乡里辞也，莫不悲号动天，奋身决赴。浮尸蔽江，天为厉霾。”(徐世溥《江变纪略》)
华南
信丰之屠
信丰之屠指的是公元1649年（南明永历三年三月初一日），满清“梅勒章京”胶商在广东信丰县进行的一次大规模屠城。
根据《西江志》等记载，1649年李成栋二次入赣，为满清军所败，退守信丰。满清军攻破城池，李成栋仓促撤退，在回师过程中阵亡。满清军入城后对城中居民滥加屠杀。被屠杀的无辜居民人数不详。史称信丰之屠。
南雄大屠杀
雄之屠指的是公元1649年（南明永历三年十二月三十日），满清“平南王”尚可喜、“靖南王”耿继茂在广东南雄府进行的一次大规模屠城。
根据《岭表纪年》、《南雄府志》记载，1649年清军从江西南下进攻广东，偷渡梅岭后，派遣间谍进入南雄放火并打开城门，满清军主力拥入。守城六千余名将士死战殉国，城内居民被屠戮殆尽。大约有两万人被屠杀。史称南雄之屠。
1649年农历十二月二十九日，清军抵达南雄，年三十除夕晚上清军放火焚烧鼓楼，趁明军慌乱救火之际，攻入城内。对南雄县民大肆屠杀，“大清平、靖二藩克雄城，民尽屠戮，十存二三。”(乾隆十八年《南雄县志》)
参考文献：“家家燕子巢空林，伏尸如山莽充斥。....死者无头生被掳，有头还与无头伍。血泚焦土掩红颜，孤孩尚探娘怀乳。(清军文书陈殿桂，《雄州店家歌》)
庚寅之劫（又称广州大屠杀）
庚寅之劫，指1650年（清顺治七年，南明永历四年，庚寅年）11月24日到12月5日清朝军队在广州的屠城暴行。
当年公历11月24日，清朝平南王尚可喜与靖南王耿继茂指挥的清军（汉军镶蓝旗）在围城近十个月后，经过惨烈的战斗，包括筑垒相逼，以楼车攻城，及动用荷兰炮手，终于攻破广州城，随后对据城死守的广州居民进行了长达十二天的大屠杀，据清代官方史载，这场屠城，斩“兵民万余”，又“追剿余众至海滨，溺死者无算”，不论男女老幼，一律残酷地杀死，死亡人数根据收尸的和尚统计至七十万。
广州市社会科学研究所认为“七十万人”显然不可信，因为明末广州府十三县人口总共才40万人。另有意见认为当时广州人口约40万，而死难者约十万人或超过十万人。