关键在于，有了不同的思路和分歧怎么处理。
显而易见，官僚系统在处理异议时的原始惯性，远远超越了皇帝这些年对党内施加的影响。
整个系统，会自然而然地，理所应当地，越过皇帝，推行自己的想法。
最先出现征兆的高级官员，其实是温纯。
温纯为了将他改土归流的西南大政上升为国策，竟然当着自己和申时行的面，替杨应龙做遮掩。
这种历史上弑妻杀岳母，肆意阉割治下百姓，纵兵血洗綦江城的人，在温纯口中生生变成被土司欺负的白莲花。
而就在旁边的申时行也无动于衷。
若不是开了天眼，朱翊钧恐怕都发现不了。
当然，温纯是忠臣。
在土司、汉化土司、流官之间，拉拢汉化的杨氏打压非汉化土司，才是经得起历史检验的百年国策。
历史上大明朝走了另一条路，安抚土司，镇压了汉化土司，其结果就是土司吸取了前车之鉴，一干非汉化土司暗中联合，发动了波及川、黔、云、桂四省，死伤百余万的奢安之乱。
正因如此，在温纯瞒着皇帝也要推行这种干犯天和的国策时，朱翊钧并没有戳穿，只是将温纯调任贵州。
贬谪敲打的同时，也给温纯机会亲力亲为，操办好这事。
在温纯之后。
清丈所带来的各省民变上，文华殿的廷臣，是所有廷臣，全都不约而同地越过了皇帝的意志。
度田大家都支持，但对于其中遇到的阻碍，到底是温和劝离？还是粗暴镇压？
譬如曲阜的事。
沈鲤调动缇骑镇压曲阜，在朝中掀起不少纷争。
像汪宗伊、王国光、朱衡这些大儒，在事涉百姓的问题上，都有着超乎寻常的怜悯，对沈鲤弹劾几乎雪片一般飞入西苑，什么作风粗暴，枉顾民意云云。
朱翊钧肯定不可能让沈鲤像隆庆年间的海瑞一样，下面做事上面视为弃子的，出于对沈鲤的保全，他直接将奏疏留中不发。
这自然而然被解读为皇帝对沈鲤行为的支持。
在第二天的文华殿廷议上，群臣竟然硬顶着皇帝的暧昧态度，公开批评沈鲤！
这些廷臣本对皇帝特设巡抚下省办案的做法有意见，朱翊钧当然理解。
这是科层政治的首脑，排斥寡头政治的本能，谁坐到对应的位置上都差不多，朱翊钧也无力在每一位廷臣的脑都种中下三尸脑神丹。
但话虽如此，按照这么多年的默契而言，这些廷臣不应该越过他这个皇帝的意志。