就在朱由检处理涂文辅等人的时候，锦衣卫高层官员，已经奉他的命令进宫，在乾清宫外等候。
朱由检正想把他们召进来，先前被他派出去审问客氏的王文政回来了，带来一个消息，让他勃然大怒：
“‘宫人姙身者八人’，八个怀孕宫女！”
“客氏想做什么？想学李园故事吗？”
“把她立刻处死，儿子侯国兴下狱，家人流放海外。”
想到这件事情，他就有些后怕。幸亏登极后不久就把客氏赶出宫门，否则时间久了，真的可能生乱。
这是能坐实魏忠贤和客氏谋逆的证据，但是朱由检根本不敢公布。
在这个没有亲子鉴定的年代，谁是谁的儿子，几乎全凭话说。新建伯争袭案闹了两年，就是无法确定这一点。
所以朱由检立刻命令王文政收拾首尾，把客氏和八个宫女处理掉。免得事情传出去，民间乱传之下，以后冒出什么“天启遗腹子”，和自己争夺皇位。
还派刘若愚跟随，监视王文政处理这件事。客氏全家也要尽数监禁，确认没有隐患后流放。
对此愤怒之极，朱由检甚至想把给魏忠贤亲族的世职收回来，但是想想宫内宫外不知有多少魏忠贤的党羽，自己想重用的徐应元等人又刚刚被处理。只能把这股愤怒压下去，没有给魏忠贤加罪，免得他的党羽不安。
不过对客氏家人，朱由检就没有客气了。也不给什么世职，直接流放海外。
至于那八个宫女，朱由检也嘱咐王文政从客氏家产中分出专门款项，把她们混在被客氏害死的人之中，每人发一千两补偿。
这一千两银子要存在顺天银行账户上，让她们的家人每月领取一两。这样就能够监视她们家人，避免这些可能知道情况的人走漏风声、以后被人利用。
处理了这件事情，朱由检余怒未消，唤来田尔耕、许显纯等锦衣卫高层，对他们破口大骂。怪这些人没有当好耳目，没发现魏忠贤谋逆。
这些锦衣卫高层感到有些委屈，相比能待在皇帝身边的东厂太监来说，他们很难见到皇帝。又因为受到东厂监督，只能依附东厂。
除了嘉靖朝的陆炳之外，锦衣卫面对东厂的时候基本都在下风。在魏忠贤权倾朝野的时候，完全沦为附庸。
所以对皇帝指责他们不能发现魏忠贤的逆谋，他们根本不接受。毕竟魏忠贤是他们的上司，又是他们沟通皇帝的渠道，他们怎么发现魏忠贤的逆谋、再告发给皇帝？
不过皇帝发怒，他们也只能听着。直到朱由检将火气发出来，才有一位锦衣卫指挥方弘瓒道：
“陛下，前锦衣卫指挥同知、署北镇抚司刘侨，因为不肯杀人媚珰，被魏逆削籍为民。”
“臣请召回此人。”
朱由检发了通火，听到锦衣卫还有这样的人，当即便下令道：