在此之后，波格尔-下等人就率领吉奥诺西斯人加入了杜库伯爵的分离主义运动，并且成为了独立星系邦联的核心种族之一。
波格尔-下等人有着极为庞大的野心，他希望带领吉奥诺西斯人成为外环星区的霸主，而他加入杜库伯爵这边，也是出于这个目的。
在他的主持下，吉奥诺西斯人的科技力量和工业力量完全的爆发出来，独立星系邦联一大半的B-1战斗机器人和B-2超级战斗机器人全都是吉奥诺西斯人制造的。
不仅如此，吉奥诺西斯人还完成了DS-1战斗空间站主体结构的研发工作，还和技术联盟合作，进行了超级坦克、B-3战斗机器人等先进武器的研发。他们自己也有建造主力舰、星际战机的能力，只是产量相对于机器人来说很低而已。
然而随着克隆人战争的不断推进，独立星系邦联的科研和工业核心逐渐朝着黎明星球转移，这让波格尔-下等人感受到了极大的威胁。而最重要的行动，就是黎明星球占领克里斯托夫西斯星球，以及在塔图因星球保持了强大的影响力。
这两颗星球都临近吉奥诺西斯星球，从而让波格尔-下等人坐立难安。
当杜库伯爵和达斯-西迪厄斯渐行渐远之后，波格尔-下等人认为这场战争已经必然失败，所以他和有着同样看法的技术联盟大工头沃特-坦伯秘密勾结起来，悄悄地倒向了达斯-西迪厄斯这一边。
吉奥诺西斯人实际上本身就是技术联盟的重要成员，所以波格尔-下等人和沃特-坦伯之间的关系一直就很好。
正好在这时候，银河共和国的舰队已经第二次进攻吉奥诺西斯星球，并且在安纳金-天行者、欧比旺-肯诺比的带领下杀入星球的机器人工厂，摧毁了他们的超级坦克研发中心。
绝地武士带领下的共和国舰队势如破竹的力量终于让波格尔-下等人以及沃特-坦伯下定了决心，他们秘密向银河共和国的议长帕尔帕廷投降。
而帕尔帕廷也在原力当中看到了他们内心的恐惧，威胁他们要把技术联盟的斯卡科星球以及吉奥诺西斯星球犁为平地。两人在极度惊恐之下，接受了帕尔帕廷提出的一切条件。
这个条件，就是帮助他完成DS-1战斗空间站的建造。
在这时候，吉奥诺西斯人的内部也出现了问题。那些曾经被波格尔-下等人击败的上等种姓开始蠢蠢欲动，准备推翻波格尔-下等人的统治，重塑吉奥诺西斯人的种姓制度。
遭到战争削弱的波格尔-下等人担心自己无力应对上等种姓的反扑，于是在达斯-西迪厄斯的蛊惑下，作出了一个非常残酷的决定——他打算绑架卡琳娜大帝（QueenKarinatheGreat），然后再让银河共和国的舰队轰炸吉奥诺西斯星球，将星球彻底摧毁，同时也消灭绝大部分的吉奥诺西斯人。
在这之后，他就能控制卡琳娜大帝，以他自己为核心，重建吉奥诺西斯人的社会，这样一来，他就成了整个种族至高无上的统治者，再也没人能够撼动他的地位。
波格尔-下等人的行动成功了一半，他成功绑架了卡琳娜大帝，并且将她带去了塔拉西亚星球，孵化出大量的劳工种姓吉奥诺西斯人，为达斯-西迪厄斯秘密建造DS-1战斗空间站。
然而，达斯-西迪厄斯却并没有兑现他的承诺。虽然当黎明星球退出战争之后，独立星系邦联迅速土崩瓦解，失去了卡琳娜大帝的吉奥诺西斯人无法得到人口补充，损失极为惨重。
但是银河帝国却忌惮黎明王国在银河系南境的力量，尤其是克里斯托夫西斯星球在侧翼的威胁，因此他们并没有摧毁吉奥诺西斯星球，而是把精力集中在赖诺思星球，准备重建第14军身上。
同时，那些群龙无首的吉奥诺西斯人在走投无路之下，只能求助于唐骁。唐骁立刻就明白，这个阴谋就是达斯-西迪厄斯为了推进死星的建造而做的，虽然做法和原剧情不同，但是目的却是完全一样。